Japan-Places.com ने कुमामोटो में लगभग 2 प्राथमिक विद्यालय को सूचीबद्ध किया है। . कुमामोटो के कुछ टॉप रेटेड प्राथमिक विद्यालय हैं। कुमामोटो सिटी होंजो चिल्ड्रन डेवलपमेंट क्लब & कुमामोटो शिरित्सु होंजो प्राथमिक विद्यालय.