Japan-Places.com ने मात्सुमोतो में लगभग 1 गैर लाभकारी संगठन को सूचीबद्ध किया है। . मात्सुमोतो के कुछ टॉप रेटेड गैर लाभकारी संगठन हैं। वर्कर्स कॉर्प नागानो ब्रांच (NPO Corporation).