Japan-Places.com ने जापान में लगभग 262 विज्ञान संग्रहालय को सूचीबद्ध किया है। . जापान के कुछ टॉप रेटेड विज्ञान संग्रहालय हैं। प्रकृति और विज्ञान का राष्ट्रीय संग्रहालय, उभरते विज्ञान और नवाचार का राष्ट्रीय संग्रहालय, ओसाका विज्ञान संग्रहालय, वैमानिकी विज्ञान संग्रहालय, विज्ञान संग्रहालय, ओखोटस्क रयु ह्य संग्रहालय, फुकुओका सिटी साइंस संग्रहालय, मिसावा एविएशन एंड साइंस म्यूज़ियम, मिसावा एविएशन एंड साइंस म्यूज़ियम & ओकुटामा वाटर एंड ग्रीन फ्रेंडशिप हॉल.