Japan-Places.com ने जापान में लगभग 164 पुरातत्व संग्रहालय को सूचीबद्ध किया है। जापान के कुछ टॉप रेटेड पुरातत्व संग्रहालय हैं। मुनाकाता ताइशा शिनपोकाना, शोगुनामा दफन टीले प्रदर्शनी हॉल, मोयोरो शैल माउंड संग्रहालय, मटका जोमोनकान, ताकामात्सुका मुरल संग्रहालय, निजो-सान संग्रहालय, इदोजिरी पुरातत्व संग्रहालय, आओया कामितेराची हेरिटेज मेसियम, Kinseizan जीवाश्म संग्रहालय & Kinseizan जीवाश्म संग्रहालय।