Japan-Places.com ने जापान में लगभग 824 बॉटनिकल गार्डन्स को सूचीबद्ध किया है। जापान के कुछ टॉप रेटेड बॉटनिकल गार्डन्स हैं। कोच्चि प्रीफेक्चुरल माकिनो बॉटनिकल गार्डन, तोतोरी फ्लावर पार्क, हिबिया कदन ऑफुना फ्लावर सेंटर ऑफुना बॉटनिकल गार्डन, नागाई बॉटनिकल गार्डन, कवाची विस्टेरिया गार्डन, ओडवारा फ्लावर गार्डन, अलोहा गार्डन ततेयामा, वेटलैंड्स का हकोन बॉटनिकल गार्डन, कनागावा पब्लिक काना गार्डन & हिरोशिमा बॉटनिकल गार्डन।