Japan-Places.com ने मिनाटो सिटी में लगभग 1 प्राथमिक विद्यालय को सूचीबद्ध किया है। मिनाटो सिटी के कुछ टॉप रेटेड प्राथमिक विद्यालय हैं। नानजान प्राथमिक विद्यालय।