Japan-Places.com ने जापान में लगभग 133 प्राकृतिक इतिहास संग्रहालय को सूचीबद्ध किया है। जापान के कुछ टॉप रेटेड प्राकृतिक इतिहास संग्रहालय हैं। झील नोजिरी नौमानज़ौ संग्रहालय, झील नोजिरी नौमानज़ौ संग्रहालय, झील नोजिरी नौमानज़ौ संग्रहालय, जेनबुडो संग्रहालय, ओमाची अल्पाइन संग्रहालय, ओमाची अल्पाइन संग्रहालय, ओमाची अल्पाइन संग्रहालय, मियागी प्रान्त इज़ुनुमा-उचिनुमा अभयारण्य केंद्र, हीराओदाई नेचर ऑब्जर्वेशन सेंटर & आसमा ज्वालामुखी संग्रहालय।