Japan-Places.com ने जापान में लगभग 59 ग़ैर सरकारी संगठन को सूचीबद्ध किया है। जापान के कुछ टॉप रेटेड ग़ैर सरकारी संगठन हैं। जापान वित्तीय योजनाकार संघ कनागावा शाखा (एनपीओ निगम), जापान इंजील लूथरन एसोसिएशन, परामर्श सहायता केंद्र इरोडोरी, परामर्श सहायता केंद्र इरोडोरी, मिनामियासो सहायता केंद्र, बीई टाउन चैंबर ऑफ कॉमर्स, पोर्ट एंड एयरपोर्ट टेक्नोलॉजी प्रमोशन एसोसिएशन, नरक मसुदा, वैश्विक विकास अनुसंधान केंद्र (जीडीआरसी) & जापान युवा सम्मेलन केंद्र ओकिनावा जिला परिषद।