Japan-Places.com ने मिनाटो सिटी में लगभग 1 गैर लाभकारी संगठन को सूचीबद्ध किया है। मिनाटो सिटी के कुछ टॉप रेटेड गैर लाभकारी संगठन हैं। 1-9-3 शिबौरा मिनातो-कू पीडी बिल्डिंग दूसरी मंजिल किड्स डोर।