Japan-Places.com ने मियाकोजिमा वार्डो में लगभग 3 गैर लाभकारी संगठन को सूचीबद्ध किया है। मियाकोजिमा वार्डो के कुछ टॉप रेटेड गैर लाभकारी संगठन हैं। फ्रेश केयर एसोसिएशन (एनपीओ कॉर्पोरेशन), इंटरनेशनल फ्रेंडशिप क्लब & फ्रेंड स्पेस (निर्दिष्ट गैर-लाभकारी संगठन)।