Japan-Places.com ने यमातो में लगभग 1 गैर लाभकारी संगठन को सूचीबद्ध किया है। यमातो के कुछ टॉप रेटेड गैर लाभकारी संगठन हैं। माईसेरा जापान एक निर्दिष्ट गैर-लाभकारी संगठन।