Japan-Places.com ने योकोहामा में लगभग 5 गैर लाभकारी संगठन को सूचीबद्ध किया है। योकोहामा के कुछ टॉप रेटेड गैर लाभकारी संगठन हैं। एनपीओ एबीसी जापान, दोस्तों (एनपीओ कॉर्पोरेशन), जापान आर्मर कराटेडो फेडरेशन (एनपीओ कॉर्पोरेशन), ब्राजीलियाई व्यापार समूह एशिया जापान & निर्दिष्ट गैर-लाभकारी निगम तीसरा स्थान।