Japan-Places.com ने नागासाकी में लगभग 1 धार्मिक संस्थान को सूचीबद्ध किया है। नागासाकी के कुछ टॉप रेटेड धार्मिक संस्थान हैं। सेकाई मसीहा क्यो नागासाकी चर्च।