Japan-Places.com ने क्योटो में लगभग 1 अनुसन्धान संस्थान को सूचीबद्ध किया है। क्योटो के कुछ टॉप रेटेड अनुसन्धान संस्थान हैं। क्योटो यूनिवर्सिटी ऑफ आर्ट जापान ट्रेडिशनल म्यूजिक रिसर्च सेंटर (क्योटोगीडाई जेटीएम)।