Japan-Places.com ने सुकुबा में लगभग 4 अनुसन्धान संस्थान को सूचीबद्ध किया है। सुकुबा के कुछ टॉप रेटेड अनुसन्धान संस्थान हैं। नेशनल इंस्टीट्यूट ऑफ एग्रोबायोलॉजिकल साइंसेज, कृषि अनुसंधान संगठन सुकुबा प्रबंधन केंद्र, एनएफआरआई-नारो नोरिंडांची & नेशनल इंस्टीट्यूट ऑफ एग्रोबायोलॉजिकल साइंसेज।