Japan-Places.com ने मात्सुमोतो में लगभग 2 स्कूलों को सूचीबद्ध किया है। मात्सुमोतो के कुछ टॉप रेटेड स्कूलों हैं। नागानो शिमौची कैंपस का इंटरनेशनल स्कूल & स्टेप्स इंग्लिश स्कूल।