Japan-Places.com ने Minamata में लगभग 2 स्कूलों को सूचीबद्ध किया है। Minamata के कुछ टॉप रेटेड स्कूलों हैं। मिनामाता सिटी मिनामाता दाइची प्राथमिक विद्यालय हमा शाखा विद्यालय & मिनामाता सिटी मिनामाता दाइची जूनियर हाई स्कूल हमा ब्रांच स्कूल।