Japan-Places.com ने मिनाटो सिटी में लगभग 2 स्कूलों को सूचीबद्ध किया है। मिनाटो सिटी के कुछ टॉप रेटेड स्कूलों हैं। साउथ स्कूल बिल्डिंग & कीयो विश्वविद्यालय।