Japan-Places.com ने शिंजुकु सिटी में लगभग 3 स्कूलों को सूचीबद्ध किया है। शिंजुकु सिटी के कुछ टॉप रेटेड स्कूलों हैं। टोक्यो इंटरनेशनल एकेडमी, इकुशु & टोक्यो अंतर्राष्ट्रीय सांस्कृतिक संस्थान।