Japan-Places.com ने शिंजुकु सिटी में लगभग 5 स्कूलों को सूचीबद्ध किया है। शिंजुकु सिटी के कुछ टॉप रेटेड स्कूलों हैं। ट्रूंग ऋण, आईएसआई केंद्र भवन।, गक्को होजिन एज़ोएगाकुएन शिंजुकुनिहोंगो स्कूल, कीतेई जुकु & शुमन शाखा स्कूल।