Japan-Places.com ने जापान में लगभग 101 बंदरगाहों को सूचीबद्ध किया है। जापान के कुछ टॉप रेटेड बंदरगाहों हैं। नागोया पोर्ट, नुमाज़ू पोर्ट, योकोहामा पोर्ट, ओहारा पोर्ट, नाहा पोर्ट पैसेंजर वेटिंग एरिया, रयोत्सु पोर्ट, गिनोवन पोर्ट मरीना, किनागाशिमा पोर्ट, सुमोटो पोर्ट & कत्सुरा पोर्ट।