Japan-Places.com ने मात्सुमोतो में लगभग 2 विश्वविद्यालयों को सूचीबद्ध किया है। मात्सुमोतो के कुछ टॉप रेटेड विश्वविद्यालयों हैं। मात्सुमोतो विश्वविद्यालय शैक्षणिक मामलों के प्रभाग & मात्सुमोतो विश्वविद्यालय विस्तार केंद्र।