Japan-Places.com ने क्योटो में लगभग 6 विश्वविद्यालय पुस्तकालय को सूचीबद्ध किया है। क्योटो के कुछ टॉप रेटेड विश्वविद्यालय पुस्तकालय हैं। क्योटो विश्वविद्यालय पुस्तकालय, क्योटो एनर्जी साइंस ग्रेजुएट कोर्स लाइब्रेरी विश्वविद्यालय, क्योटो यूनिवर्सिटी ग्रेजुएट स्कूल ऑफ इकोनॉमिक्स फैकल्टी ऑफ इकोनॉमिक्स लाइब्रेरी, क्योटो यूनिवर्सिटी ग्रेजुएट स्कूल ऑफ इंफॉर्मेटिक्स लाइब्रेरी, क्योटो यूनिवर्सिटी ग्रेजुएट स्कूल ऑफ लेटर्स लाइब्रेरी & क्योटो यूनिवर्सिटी ग्रेजुएट स्कूल ऑफ ग्लोबल एनवायरनमेंटल स्टडीज गाकुशा लाइब्रेरी।