Japan-Places.com ने जापान में लगभग 307 चिड़ियाघरों को सूचीबद्ध किया है। जापान के कुछ टॉप रेटेड चिड़ियाघरों हैं। अटागावा ट्रॉपिकल एंड एलीगेटर गार्डन, आसा चिड़ियाघर, इनोकाशिरा पार्क चिड़ियाघर, नोबोरिबेट्सु भालू पार्क, कुमामोटो सिटी जूलॉजिकल एंड बॉटनिकल गार्डन, माचिदा गिलहरी उद्यान, उत्तर सफारी सपोरो, एसो कडली डोमिनियन, उत्सुनोमिया चिड़ियाघर & इतोज़ु नो मोरी पार्क।