Japan-Places.com ने जापान में लगभग 307 चिड़ियाघरों को सूचीबद्ध किया है। जापान के कुछ टॉप रेटेड चिड़ियाघरों हैं। नोगेयामा चिड़ियाघर, क्योटो सिटी चिड़ियाघर, सीतामा चिल्ड्रन ज़ू, टोबू चिड़ियाघर सैतामा, सीतामा चिल्ड्रन ज़ू, सीतामा चिल्ड्रन ज़ू, सीतामा चिल्ड्रन ज़ू, शोआ शिनजान भालू Ranch, ज़ाō फॉक्स विलेज & फुकुओका चिड़ियाघर और बॉटनिकल गार्डन।