Japan-Places.com ने जापान में लगभग 540 प्रोटेस्टेंट चर्च को सूचीबद्ध किया है। जापान के कुछ टॉप रेटेड प्रोटेस्टेंट चर्च हैं। एंडो मेमोरियल चर्च, अनुग्रह समुदाय, जापान में राकुयो चर्च यूनाइटेड चर्च ऑफ क्राइस्ट, मिहामा चर्च, जापान में यूनाइटेड चर्च ऑफ क्राइस्ट कावासाकी चर्च, शीबा चर्च, टोरिज़ाका चर्च जापान में यूनाइटेड चर्च ऑफ क्राइस्ट, इग्रेजा बेतेल कुवाना, टोक्यो विजन चर्च टोक्यो विजन चर्च (प्रोटेस्टेंट) & साल्वेशन आर्मी कोटो स्क्वाड्रन।